Utilisation de la PCR multiplex comme outil diagnostique de la pneumopathie aiguë communautaire

Objectifs Des outils de detection rapide des bacteries et des virus impliques dans les infections pulmonaires ont ete developpes pour pallier les difficultes rencontrees au cours de la pandemie grippale a virus A(H1N1)pdm2009. L’absence de diagnostic avait rendu difficiles la mise en place de mesures preventives et l’utilisation ciblee des antiviraux. Depuis les techniques de PCR multiplex qui ciblent 15 a 20 pathogenes sur un prelevement unique se sont etablies dans la routine. Les objectifs de ce travail etaient d’evaluer l’utilisation de la PCR multiplex comme outil diagnostique des pneumopathies aigues communautaires (PAC) et de tester un outil PMSI de mesure d’impact medical et economique de son utilisation. Methodes Les patients avec PAC hospitalises en pneumologie et en reanimation polyvalente au CHRU de Tours ont ete selectionnes a partir d’un algorithme PMSI sur trois hivers (semaine 38 a semaine 18 de l’annee suivante) : avant l’utilisation de la PCR multiplex (2008–2009), en utilisation hebdomadaire (2010–2011) et en routine quotidienne (2011–2012). Un retour aux dossiers sur un echantillon aleatoire de 570 patients a permis la validation de l’algorithme PMSI. Un recueil de variables d’interet (duree de sejour, duree d’antibiotherapie, prescription d’antiviraux, nombre et type de prelevements a visee microbiologique, ventilation mecanique, ECMO) a ete mene pour mesurer l’impact de l’utilisation de cette innovation sur la prise en charge et evaluer l’impact economique (estimation des couts). Resultats Il y avait 1349 patients hospitalises pour PAC sur la periode. Les parametres de performance du PMSI etaient : sensibilite 94 %, specificite 85 %, valeur predictive positive 83 %, valeur predictive negative 95 %. En 2010–2011, 27 % [IC95 % 25,6–27,6 %] des PAC hospitalisees avaient beneficie d’une PCR, dont 18,2 % [IC95 % 17,5–19 %] en pneumologie et 37,2 % [IC95 % 35,7–38,8 %] en reanimation, et 33,5 % [IC95 % 32,2–34,9 %] en 2012–2013, dont 13,0 %[IC95 % 12,5–18,4 %] en pneumologie et 66,9 % [IC 95 % 64,3–69,8 %] en reanimation. En 2010–2011, 58 % des PCR etaient positives et 67 % en 2011–2012. Les analyses de l’impact medico-economiques sont en cours. Conclusion La PCR multiplex n’est pas un outil diagnostique systematique de patients hospitalises pour PAC, y compris pour les PAC severes.