Zuckerseitige Wechselwirkungen in einem DNA‐RNA‐G‐Quadruplex: Hinweise auf sequentielle C−H⋅⋅⋅O‐Wasserstoffbrücken als Beitrag zur RNA‐Quadruplex‐Faltung

DNA-G-Quadruplexe wurden systematisch an anti-dG-Positionen mit einzelnen Riboguanosin-Bausteinen (rG) modifiziert. Zirkulardichroismus- und NMR-Experimente bestatigen den Erhalt der nativen Quadruplex-Topologie fur den Grosteil der DNA-RNA-Hybridstrukturen. Veranderungen in der C8-chemischen Verschiebung von Guanosinen an der 3′-Seite einer rG-Substitution im Quadruplex-Kern legen C8-H⋅⋅⋅O-Wasserstoffbrucken mit dem O2′ des C2′-endo-Ribonukleotids nahe. Eine geometrische Analyse bekannter, hochaufgeloster Strukturen deutet darauf hin, dass entsprechende Wechselwirkungen ein allgemeineres Merkmal in RNA-Quadruplexen sind und moglicherweise zur beobachteten Praferenz fur parallele Topologien beitragen.