SETBP1 Geninde Mental Retardasyon Tip 29 Sendromuyla Ilişkili Yeni Mutasyon Tanımlanması: Olgu Sunumu

ÖzetAmaç: Mental retardasyon genetik ve çevresel faktörlerin etkilileri sonucu ortaya çıkan konjenital anomalilerdir. Genetik bozuklukların Mental retardasyonun gelişmesindeki etkinliği göz önüne alındığında genetik tanın hastalığın teşhisi ve tedavisideki rolü büyük önem taşımaktadır. Bu çalışmada amacımız zihinsel engelli tanısı konulan hastada, hastalığın genetik sebeplerinin detaylı bir şekilde araştırılmasıdır. Gereç ve yöntemler: Bu çalışmada Yeni Nesil Dizileme (NGS) teknolojisi kullanılmıştır. İnsanlardaki 60MB'lık ekzom bölgeleri," Agilent Sure Select Human All Exon V6" kiti kullanılarak zenginleştirilmiştir. Zenginleştirilen kütüphane, Illumina yeni nesil dizileme platformunda ortalama 100X kapsama ile dizilenmiştir. Sonuçların biyoinformatik analizi Burrows-Wheeler Aligner programı ile GRCh37/hg19 genom hizalaması kullanılarak yapılmış. Bulgular: Yeni nesil dizileme yöntemi (NGS) kullanılarak hastanın tüm genomundaki protein kodlayan genlerin (WES) dizilenmesi sonucunda, klinik bulgularla ilişkili olarak SETBP1 geninde heterezigot otomozmal baskın değişim saptanmıştır. ACMG kriterlerine göre bu değişim klinik etkisi henüz bilinmeyen (VUS) yeni bir mutasyon c.3515G gt;T olarak sınıflandırılmıştır. Hastada bulunan bu yeni mutasyon Sanger dizileme ile doğrulanmıştır. SET bağlayıcı protein 1’ in (SET binding protein 1), beyin hücrelerinin gelişiminde ve işlevinde son derece önemli bir rolü olabileceği öngörülmektedir.Sonuç: Mental retardasyonda erken dönemde teşhis koyulması ve müdahale edilmesi durumunda hastalığın seyrinin daha olumlu yönde gitmesi sağlanabilir ve tedavisinde büyük farklar yaratılabilir. Hastada SETBP1 geninde heterozigot olarak saptanmış olan yeni mutasyon, hastanın verilen klinik bulguları ile ilişki göstermektedir. Bu çalışma, SET bağlayıcı protein 1'in (SETBP1), beyin hücrelerinin gelişiminde ve fonksiyonunda önemli bir rol oynayabileceğini, dolayısıyla fonksiyonunu bozulmuş bu proteinin, hastanın zihinsel gelişiminde geriliğe neden olduğunu öne sürülmektedir.