引起神经症状的柯萨奇A组16型病毒分子流行病学分析

目的 分析引起神经症状的柯萨奇病毒A组16型病毒(coxsackievirus A16, CA16) VP1基因特征.方法 采集表现神经症状的病例临床标本及信息,采用荧光RT-PCR方法检测病原,肠道病毒阳性标本进行病毒分离培养,培养阳性标本采用RT-PCR方法扩增VP1序列并测序.利用DNAStar 5.0和Mega 5等生物学软件进行基因序列及亲缘进化分析.同时收集病例的临床及流行病学信息,采用SPSS软件进行统计分析.结果 15份标本来源于12例临床诊断为病毒性脑炎或手足口合并神经症状的患者,8例有临床信息记载的都表现有发热、皮疹、脑膜刺激征和颈项强直的症状,临床症状和发病时间不呈现典型的聚集性.01111、01169和01130三例患者分别采集了两份标本,除了01169来源的两份标本间有一个碱基的差别,两份标本来源的VP1序列核苷酸和氨基酸相似性均为100%.15株毒株之间的核苷酸同源性为94.5% ~100%,氨基酸同源性为98.0% ~100%.15株毒株和原型株G10的核苷酸同源性为68.5% ~70.5%,氨基酸同源性为90.5% ~91.9%.系统进化分析显示,本研究15株序列全部属于B1b簇,又分属三小簇.结论 引起神经症状的15株CA16均为B1b基因型,深入开展CA16分子流行病学对我国HFMD的防控及疫苗的研发将提供重要参考.