2014-2017年盐城地区甲型H1N1流感病毒HA、NA基因变异分析

Chinese Journal of Clinical Hepatology(2018)

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摘要
目的 研究盐城地区2014-2017年甲型H1N1血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)分子遗传进化特征.方法 将盐城地区2014-2017年流感监测哨点医院以及流感暴发点采集的流感样病例标本进行核酸、病毒分离检测,选取2014-2017年甲型H1N1毒株,采用一步法RT-PCR方法扩增HA1和NA基因,扩增产物经测序,采用相应的生物信息软件进行核苷酸和氨基酸位点变异及基因种系进化特征分析.结果 2014-2017年抽取的17株甲型H1N1毒株HA1和NA基因各自分支的聚类关系基本一致,分为4个进化分支.与疫苗株A/California/07/2009(H1N1)相比,盐城地区毒株HA1基因编码区共涉及3个抗原表位(Ca、Sa、Sb)和6个抗原位点(K154R、S162N、K163Q、S185T、L191I、S203T)变异;受体结合位点220环中有3个位点(D222G/N、G223R和E224K)发生变异,190螺旋中涉及1个位点(L191I)的变异;2017年两株毒株(A/Jiangsu-YC/SWL1540/2017、A/Jiangsu-YC/SWL1545/2017)增加了1个162NQS糖基化位点.抗原表位、受体结合位点、糖基化位点发生了一定程度变异,导致在基因层面上A/California/07/2009(H1N1)疫苗株产生的保护效果有限,而2017年分离的两株毒株(A/Jiangsu-YC/SWL1540/2017和A/Jiangsu-YC/SWL1545/2017)与疫苗株A/Michigan/45/2015(H1N1)具有较好的保护效果.17株分离株未发生NA蛋白酶活性位点以及耐药位点的变化,部分毒株NA基因编码糖基化位点有一定变化.结论 2014-2017年盐城地区流行的甲型H1N1毒株HA1和NA基因正逐渐发生变异,这些变异位点的积累很可能会导致流感病毒发生实质性的抗原性的漂移.
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关键词
Influenza A/H1N1 (09pdm) virus,RT-PCR,Hemagglutinin gene,Neuraminidase gene,Sequencing
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