湖南省蛇源裂头蚴线粒体nad4和nad5基因遗传多样性分析

Zhongguo xue xi chong bing fang zhi za zhi = Chinese journal of schistosomiasis control(2021)

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摘要
目的 了解湖南省蛇源裂头蚴种群遗传多样性及其系统发生关系.方法 采用PCR技术扩增湖南省7株蛇源裂头蚴线粒体nad4基因和nad5基因部分序列(pnad4和pnad5),扩增产物测序后用DNAMAN 7.0、MegAlign、DnaSP5.0和MEGA 5.0软件进行同源性和系统进化分析.结果 湖南省7株蛇源裂头蚴pnad4和pnad5基因序列长度分别约为578 bp和484 bp,其碱基变异率分别为0~2.8%和0~0.8%;均检测到4个单倍型,总单倍型多样性分别为0.810±0.016和0.905±0.011,核苷酸多样性分别为0.006±0.005和0.004±0.003,平均核苷酸差异为3.960和1.905.构建的系统进化树显示,7株裂头蚴分离株与来自不同地区或不同宿主的猬迭宫绦虫同在一个分支,属于猬迭宫绦虫;与阔节迭宫绦虫相隔较近,与其他绦虫相隔较远.结论 湖南省蛇源猬迭宫绦虫遗传变异程度低,pnad4基因和pnad5基因均可作为检测猬迭宫绦虫的分子遗传标记.
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关键词
Hunan Province,Phylogenetic analysis,Snake-derived Spironmetra erinaceieuropaei,nad4 gene,nad5 gene
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