基于microRNA测序分析miRNA在刺葡萄抗白腐病中的作用

[目的]在前期的种质资源评价过程中,发掘一株中国野生刺葡萄0943,该株系高抗葡萄白腐病.基于microRNA (miRNA)在植物抗病中的重要作用,拟从miRNA水平探讨刺葡萄在受到病原菌侵染后的表达调控机制.[方法]以抗病的中国野生刺葡萄为试材,对比感病的欧亚种‘美人指’,分别以病原菌诱导,在0 hpi(hours post inoculation)和病菌诱导后的12 hpi、36 hpi处理后采样,进行二代测序,并对数据进行KEGG及表达量的差异分析.[结果]对比感病葡萄‘美人指’,分析了抗病刺葡萄在基础代谢和抗病途径中的差异,结合miRNA的表达量,获得了150个表达量发生变化的miRNA,其中44个miRNA的表达在刺葡萄和‘美人指’之间存在差异.5个miRNA在刺葡萄中特异表达,但是在‘美人指’中不表达,实施定量验证了这一结果.靶基因预测显示,其靶基因包括与抗病的紧密相关的WRKY、SPL、EFR等转录因子,还包括与抗病直接相关的LRR类的抗病基因.[结论]筛选出5个在刺葡萄上特异表达候选miRNA(miR 172a、miR172b、miR845a、novel 81和miR159a),可作为刺葡萄抗白腐病研究的目标.