伴与不伴糖尿病肾病的糖尿病视网膜病变患者血浆蛋白质组学研究

The Journal of Practical Medicine(2019)

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摘要
目的 研究伴与不伴糖尿病肾病(DN)的糖尿病视网膜病变(DR)患者血浆蛋白质组学,寻找差异表达蛋白,为筛选相关血浆标志物提供依据.方法 入组16例T2DM患者,8例DR伴DN患者纳入DNDR组,8例单纯DR患者纳入DR组,利用蛋白质组非标记(label-free)定量技术对16例血浆标本进行检测,并行液相串联质谱分析(LC-MS/MS),计算蛋白质表达丰度,筛选差异蛋白并行生物信息学分析,包括基因本体(GO)和代谢与信号转导通路(Pathway)注释和富集分析、差异蛋白相互作用网络分析.ELISA法检测两组患者血浆IGFBP7、CPS1水平,验证label-free结果.结果 以均数和中位数差异倍数均≥2.5倍(上/下调)为标准,筛选出差异蛋白17个,上调11个,下调6个.GO富集分析显示结合蛋白在分子功能蛋白中占绝对优势.Pathway富集分析示CPS1在丙氨酸,天冬氨酸和谷氨酸代谢中起作用.蛋白相互作用网络分析显示HSPG2、CPS1、IGFBP7、TLN1、KRT5之间有相互作用.ELISA法结果显示IGFBP7在DR组较DNDR组表达升高,CPS1在DR组较DNDR组表达降低.结论 采用label-free定量技术发现DR组与DNDR组存在多种差异表达蛋白,这些差异蛋白提供了不同的候选相关血浆标志物和早期防治的靶点.
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