冠状病毒感染相关心肌损伤机制的组学分析及治疗药物的预测

目的 研究冠状病毒感染相关心肌损伤机制并预测可能有效的治疗药物.方法 在基因表达数据库检索并筛选得到GSE59185数据集,根据不同的亚型分为wt组、△E组、△3组、△5组和对照组.用R语言Limma程序包对各组进行差异表达基因分析,将各组上调、下调表达基因分别取交集,作为共同差异表达基因,在DAVID数据库进行基因本体学(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.采用自主研发的表观精准治疗预测平台(EpiMed)进行治疗药物预测.用STRING数据库对共同差异表达基因构建蛋白质互作网络并筛选核心基因.结果 各组差异表达基因分析,共交集上调基因191个,下调基因18个,共同差异表达基因共209个.GO富集分析发现,共同差异基因主要富集在病毒反应、病毒防御反应、Ⅰ型干扰素反应、γ干扰素调节、γ干扰素介导的信号通路、先天免疫反应调节等;KEGG通路富集主要与细胞因子与受体相互作用、病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体相互作用、TNF、Toll样受体、缺氧诱导因子1及白细胞介素17信号通路等有关.通过EpiMed预测的药物主要为白藜芦醇、利托那韦、维甲酸、连翘、鱼腥草等.网络分析筛选得到干扰素调节因子7、干扰素刺激基因15、抗粘液病毒基因1、β型蛋白酶体亚基8、干扰素调节因子9、2',5'-寡聚腺苷酸合成酶(OAS)1、OAS2、OAS3、含基本S腺苷蛋氨酸域2、2',5'-寡聚腺苷酸合成酶样等核心基因.结论 多个炎症通路的异常活化可能是冠状病毒感染后患者发生心肌损伤的原因.白藜芦醇、利托那韦、维甲酸、连翘、鱼腥草可能对此具有治疗作用.