PAIP1结合RNA测序及整合分析
Experimental and Laboratory Medicine（2019）
摘要
目的 分析PAIP1结合RNA的分子特征,探讨PAIP1的新功能.方法 采用Illumina Xten测序平台对HeLa细胞进行建库测序,通过对PAIP1结合RNA进行整合分析,分析PAIP1结合RNA的分子特征,对PAIP1结合靶基因进行KEGG聚类分析.结果 PAIP1具有广泛的RNA结合活性,结合显著富集在CDS和Intron区域;KEGG分析表明,PAIP1结合的RNA分子主要参与了焦点粘连、 剪切体、RNA转运、 蛋白多糖在癌症中的作用、HIF-1信号通路、PI3K-Akt信号通路.结论 PAIP1具有结合RNA分子的功能,是一个新的RNA结合蛋白,可能在肿瘤的发生、发展过程中发挥作用.
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