人甲状腺乳头状癌的环状RNA表达谱研究

目的 为探讨甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)的发病机制,采用基因芯片技术,分析circular RNAs(circRNAs)在甲状腺乳头状癌及其癌旁组织中的表达谱差异及临床意义.方法 收集3例手术切除的甲状腺乳头状癌组织及对应癌旁组织,采用基因芯片技术分别检测其circRNA表达谱,并进行组间比较与分析,以明确差异表达的circRNA,根据差异倍数选取差异最为显著的10个circRNA,采用定量RT-PCR(quantitative reverse transcription PCR,RT-qPCR)方法验证其在50对PTC患者及正常人全血中的表达情况.采用Ar-raystar公司circRNA靶基因分析软件,预测可能与上/下调明显的circRNA相互作用的靶miRNA分子.结果 与癌旁组织相比,甲状腺乳头状癌组织的circRNA表达谱存在明显差异.在表达差异最显著的10个circRNAs中,其表达上调或下调的差异倍数均超过2.5倍(3个上调,7个下调),经RT-qPCR验证结果显示,与癌旁组织相比,甲状腺乳头癌组织中hsa_circRNA_074595表达上调3.91±0.13倍(P =0.045),hsa_ circRNA_ 100778下调3.61 ±0.05(P=0.007),hsa_ circRNA_ 104348下调4.47±0.17倍(P =0.003);circRNA靶基因分析软件预测结果提示:miR-3944、-4435、-3467、-146、-92、-519和-301可能是hsa_ circRNA_074595、100778和_104348的潜在靶基因.结论 circRNA芯片可用于筛选甲状腺乳头状癌组织中差异表达的circRNA,与癌旁组织相比,多种circRNA在甲状腺乳头状癌组织中呈异常表达,这些circRNA及其潜在的靶基因可能与甲状腺乳头状癌的发生发展密切相关.