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2012— 2014 年上海市麻疹病毒学监测情况分析

Journal of Microbes and Infections(2016)

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摘要
本研究旨在通过对2012—2014年上海市麻疹病毒监测情况进行分析 ,研究上海市麻疹病毒流行株核蛋白(nucleoprotein ,NP)的基因特征 ,探索上海市不同传播链麻疹病毒的流行情况.用Vero/Slam细胞对采集的疑似麻疹病例咽拭子标本进行病毒分离 ,分离到的麻疹毒株用反转录-聚合酶链反应(reverse transcriptase-polymerase chain reaction ,RT-PCR)扩增NP羧基端450个核苷酸 ,并对扩增产物进行序列测定和基因亲缘性关系分析.2012—2014年上海市疾病预防控制中心共收到2 562份疑似麻疹病例咽拭子标本 ,分离到710株麻疹病毒流行株 ,病毒分离阳性率为27 .71% .分离到的麻疹病毒流行株中1株为D8基因型 ,8株为B3基因型 ,其余均为 H1a基因亚型.所有 H1a基因亚型分离株与世界卫生组织(World Health Organization ,WHO)参考株(GenBank No .AF045212)的核苷酸序列同源性为96 .0% ~98 .0% ,氨基酸序列同源性为92 .7% ~98 .0% .D8基因型分离株(SH12-239)与WHO参考株(GenBank No .AF280803)的核苷酸序列同源性为97 .8% ,氨基酸序列同源性为98 .6% .所有B3基因型分离株与WHO参考株(GenBank No . L46753 )的核苷酸序列同源性为96 .7% ~96 .9% ,氨基酸序列同源性为95 .3% .结果提示 ,2012—2014年上海市麻疹病毒流行株以H1a基因亚型为绝对优势亚型.上海市麻疹监测系统首次监测到 D8基因型和B3基因型麻疹病毒在中国内地的存在.
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