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一株鸭源禽4型副粘病毒的分离鉴定及遗传进化特征分析

Journal of Parasitic Biology(2018)

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摘要
目的 对不明原因死亡的家鸭进行病原鉴定及分离,对其全基因序列进行遗传信息系统发育分析,初步揭示病原的致病性和传播特点,为进一步研究禽4型副粘病毒的致病与传播机制提供科学依据. 方法 采集病死鸭脏器,经处理后接种SPF鸡胚,分离具有血液凝集特性的病原体.通过随机聚合酶链反应,用锚定特异引物对模板进行非特异性扩增.扩增产物经纯化后克隆、测序,登录NCBI数据库进行BLAST比对以确定分离毒株种类;通过Sanger测序技术对病毒进行全基因组测序,采用MEGA7.0软件进行序列比对,通过邻近归并法(Neighbor-Joining)构建种系发生进化树分析其基因特征. 结果 分离到1株血液凝集特性的病原体(SDD01),通过电镜观察、随机聚合酶链反应及测序确定为禽4型副粘病毒.PCR扩增得到其-NP-P M-F-HN-基因全长序列以及L基因的完整CDS区.F基因氨基酸基序分析显示,蛋白切割位点为DVQPR↓F,MDT> 144 h,ICPI为0.系统发育分析毒株位于东半球谱系中Ib进化分支,与APMV-4/Mallard/Hubei/2014等野鸟源病毒株同源性为99.4%. 结论 在死亡家鸭脏器中分离到禽4型副粘病毒.该病毒对鸡的致病性较低,系统发育分析其F基因与野鸟源禽4型副粘病毒同源性为99.3%~99.4%,表明家鸭感染的禽4型副粘病毒可能由野鸟引入,并可在家禽和野鸟之间循环传播.
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