规律成簇的间隔短回文重复序列对甘肃省鼠疫菌株的基因分型研究

目的 对甘肃省鼠疫菌株进行基因分型,分析不同生态型鼠疫菌株在不同行政地区、不同时间的流行趋势.方法 运用规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)对甘肃省甘宁黄鼠型(9株)、阿尔金型(18株)、祁连型(45株)及青藏型鼠疫菌株(121株)进行分型及遗传进化关系分析,分型按国际通用标准命名.并探讨甘肃省不同行政地区和不同流行时间CRISPR基因分型的变化情况.结果 甘肃省鼠疫菌株被分为2个CRISPR基因簇(Ca7和Cb4),4个基因型(7、22、24及26型).从来源地看,阿克塞、肃北、玉门、肃南均以24型[36.36％ (16/44)、36.17％(17/47)、50.00％(5/10)、38.67％(29/75)]为主基因型,夏河、会宁均以26型(4/7)为主基因型,山丹以22型(1/1)为主基因型.从时间上看,甘肃省1960-1969、1970-1979、1980-1989年鼠疫菌均以26型[53.33％(8/15)、60.00％(6/10)、48.28％(14/29)]为主基因型,1990-1999年以22型[40.91％(18/44)]为主基因型,2000-2009年以24型[43.16％(41/95)]为主基因型.结论 甘肃省鼠疫菌基因型在不同行政地区、不同时间流行趋势不同.