中国北方地区蜱携带荆门蜱病毒的分子流行特征分析

目的 通过对中国北方地区采集蜱中的荆门蜱病毒(Jingmen tick virus,JMTV)进行基因组扩增并进行系统进化分析,阐明中国北方地区JMTV的分子流行特征.方法 采集蜱样本,制备蜱悬液提取总RNA,使用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)进行JMTV检测和基因组扩增,与已知的JMTV进行序列比较及系统发生分析.结果 通过对采集于3个省级行政区[中国西北地区的新疆维吾尔自治区(新疆)博乐市、东北的辽宁省沈阳市和北京市昌平区]的277只蜱样本进行JMTV筛查,获得阳性样本67只,阳性率为24.2％;并获得4株接近全长的JMTV基因组序列,系统进化分析显示:这4株病毒在节段1、节段2、节段4与已知的新疆啮齿类中发现的JMTV聚集在一个进化分支上;但在节段3构建的进化树中,2株病毒与新疆啮齿类JMTV聚集在一起,而另2株与中国其他地区的蜱源性JMTV聚集在一起,提示可能存在基因重排.结论 同源性分析显示,新发现的4株JMTV与已知的中国地区JMTV同源性最高,具有遗传多样性.