中国大陆地区2013-2019年H7N9禽流感病毒神经氨酸酶基因特征分析

Genomics and Applied Biology(2020)

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摘要
分析中国大陆地区2013-2019年H7N9禽流感神经氨酸酶(NA)基因分子流行和遗传规律,为人感染H7N9禽流感防治提供科学依据.本研究从全球共享禽流感数据倡议组织(GISAID)数据库获得2013-2019年中国大陆地区人感染H7N9禽流感NA全长核苷酸序列.用MEGA7.0软件构建进化树,对NA基因同源性、糖基化位点和耐药位点变异进行分析,共获得1 172条序列,其主要分布于五波疫情的毒株中.其中第五波疫情毒株数最多,占总数的34.27%,分布于大陆地区26个省份(自治区,直辖市).1172份毒株NA基因在系统发育树上聚集为长江三角洲谱系和珠江三角洲谱系.同源性分析显示,2013年疫苗株与随后几年流行株匹配度越来越低,而2016年疫苗株匹配度也呈下降趋势.1167份毒株NA基因均缺失69~73 QISNT序列;与疫苗株相比,NA 5个糖基化位点因突变而消失;在6个耐药位点中均能检测到突变毒株.耐药位点中R292K替换频率最高,这种突变在第一至三波疫情中己出现,而在第五波疫情中数量增加明显.与前四波相比,在第五波疫情毒株中NA有更多的糖基化位点和耐药位点发生突变,这表明我国第五波H7N9病毒NA遗传多样性更广,变异频率更高,可能是第五波疫情感染人数增加、药物治疗效果降低的原因之一.
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