TCMSP数据库中药化学成分的SARS-CoV-2主蛋白酶抑制剂虚拟筛选
Traditional Chinese Drug Research and Clinical Pharmacology（2022）
摘要
目的 运用计算机模拟技术从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)的中药化学成分中挖掘SARS-CoV-2主蛋白酶(Main protease,Mpro)抑制剂.方法 运用类药性评估、分子对接、ADME预测、结合自由能计算、分子动力学模拟等多轮虚拟筛选的策略,从TCMSP数据库中筛选Mpro抑制剂.结果 共筛选得到10个命中分子,其中前3位最佳命中分子为MOL003392、MOL011716、MOL002966,表现出与靶标活性口袋关键氨基酸残基的强相互作用.结论 该研究可为发现SARS-CoV-2 Mpro小分子抑制剂提供新的思路.
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