猪传染性胃肠炎病毒疫苗株S基因的克隆及其与流行株的比对分析

[目的]分析猪传染性胃肠炎病毒(porcine transmissible gastroenteritis virus,TGEV)疫苗株和流行株S基因的遗传变异特征.[方法]利用RT-PCR方法对国内目前广泛使用的TGEV疫苗株A、B、C的S基因进行克隆并测序,将获得的序列与近年来公开发表的分离自不同地区的TGEV毒株S基因序列进行比对分析;选取NCBI中登录号为AF104420.1-Britain、AY587882.1-Nanjing、DQ811786.2-America、EU074218.2-Harbin、FJ755618.2-Harbin、JQ700304-fuzhou、KC609371.1-Shanghai、KX900411.1-United States、M94099.1-Spain和MK272773.1-Fushun的TGEV流行株S基因序列,与疫苗株A、B、C的S基因序列一起,利用MegAlign软件进行比对分析.[结果]疫苗株A、B、C的S基因序列两两间的同源性均在96.7％以上;疫苗株A、B、C的S基因序列与NCBI中流行株S基因序列的同源性分别在94.43％～99.82％、95.30％～99.64％、93.48％～98.38％;由遗传进化树可知,疫苗株A、C与国外流行株M94099.1-Spain在同一分支上,疫苗株B与国内流行株JQ700304-fuzhou在另一分支上.[结论]TGEV疫苗株的S基因与流行株同源性较高,变异性不大.