吉林地区1株小鹅瘟病毒NS1和VP1基因的克隆与序列分析

为了解吉林地区小鹅瘟病毒(Gosling plague virus,GPV)的基因特征,及其与黑龙江及中国其他省份和国外流行毒株的相关性,本研究采用PCR方法鉴定2018年吉林某养鹅场送检的病死雏鹅的肠组织,同时对GPV的非结构蛋白NS 1基因及结构蛋白VP 1基因进行了克隆和测序,并与国内外16株GPV参考毒株的相应序列进行分析.结果表明,病死雏鹅为GPV与减蛋综合征病毒(Egg drop syndrome virus,EDSV)混合感染;吉林地区GPV的NS 1基因长为1884 bp,编码627个氨基酸,与参考毒株核苷酸序列同源性为93.8％～99.8％,氨基酸序列同源性为97.1％～99.7％;VP 1基因长为2199 bp,编码732个氨基酸,与参考毒株核苷酸序列同源性为93.4％ ～99.9％,氨基酸序列同源性为96.4％～99.9％.NS 1及VP 1基因的系统进化树分析均表明,吉林地区GPV与哈尔滨分离株98E属于同一进化分支,亲缘关系最近,与国外分离株、中国台湾和安徽分离株亲缘关系均较远.吉林地区GPV与鹅源GPV具有较近的亲源关系,同源性明显高于其他水禽来源的GPV.该研究为明确中国东北地区GPV空间的流行规律提供基础数据,为东北地区GPV的诊断与治疗提供参考依据.