胃癌VEGF通路相关基因的预后模型的构建

目的 证实VEGF通路在胃癌发生发展中的作用,建立VEGF通路相关基因的预后风险模型,并且评价模型的预测价值和临床运用价值.方法 下载TCGA公共数据库中胃癌的转录组数据和临床数据,使用GESA富集分析验证VEGF通路在胃癌组织样品和癌旁组织样品中的富集情况.单因素COX风险回归分析和生存曲线用来筛选胃癌预后相关基因,多因素COX比例风险回归模型确定VEGF通路相关基因胃癌预后模型.ROC曲线和森林图验证该模型的预测能力.最后绘制列线图验证模型的临床价值.结果 在TCGA公共数据库下载了375例胃癌组织样品和32例癌旁正常组织样品及相应的临床数据.GESA富集显示:与正常组织比较,VEGF通路在胃癌组织中显著富集(P<0.05).单因素COX风险回归分析结果 表明有28个VEGF通路相关基因与胃癌预后息息相关.多因素COX比例风险回归模型确定预后模型风险值公式:ANKRD1,ITGAV,NOS3,NRP1,COL6A3和POSTN的基因表达量与其相应系数β相乘累加得到.生存曲线和受试者工作特征曲线(ROC)显示该模型可以准确预测胃癌患者预后,其中1、3年和5年的ROC曲线下面积(AUC)分别为65.4％,72.2％和73.0％.临床单因素和多因素COX风险回归分析显示:该模型可以成为独立于胃癌患者分级分期以外的预后因素.列线图显示:该模型具有较准确的临床运用前景.结论 本研究从生物信息学角度进一步确定了VEGF通路在胃癌发生发展过程中起到重要作用,并且建立预后相关的预后模型,为临床基因检测和靶向治疗提供了新的视角.