运用生物信息学方法探究肾上腺皮质癌的关键基因

目的:运用生物信息学方法筛选肾上腺皮质癌(adrenal cortical carcinoma,ACC)的差异表达基因,为ACC诊疗提供新的生物标志物.方法:从GEO数据库中选择基因数据集GSE14922、GSE19776、GSE12368,通过GEO2R工具在线分析,筛选出肾上腺皮质癌组织与正常肾上腺组织的差异表达基因.利用DAVID和STRING在线分析差异表达基因并构建蛋白-蛋白相互作用网络.运用Cytoscape软件筛选关键基因,使用GEPIA在线分析关键基因与ACC预后的关系.结果:共筛选出229个差异表达基因,其中上调基因51个,下调基因178个.分析显示其显著富集于细胞周期、P53信号通路,分子功能主要涉及细胞骨架蛋白组合、生长因子结合功能.MCC筛选出8个关键基因,分别是cyclinB1(CCNB1)、cyclinA2(CCNA2)、cyclin-dependent ki-nases(CDK1)、threonine-protein kinase BUB1 beta(BUB1B)、mitotic arrest deficient 2 like 1(MAD2L1)、ribonucleotide reductase M2(RRM2)、targeting protein for xenopus kinesin-like protein2(TPX2)、aurora kinase A(A URKA),通过 GEPIA 在线验证其在 ACC中高表达且与ACC患者总体生存率及无病生存率密切相关.结论:CCNB1、CCNA2、CDK1、BUB1B、MAD2L1、RRM2、TPX2、AURKA这8个基因可能作为协助ACC诊疗的新生物标志物.