1株重组H6N2禽流感病毒全基因组特征分析

Chinese Journal of Zoonoses(2021)

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摘要
目的 掌握广州地区禽类市场H6N2亚型禽流感病毒的分子遗传特征,为禽流感的科学防控提供研究数据.方法 对禽类市场外环境分离株A/EN/Guangzhou/13565/2018(H6N2)进行全基因组序列测定,应用生物信息软件分析分子遗传特征.结果 A/EN/Guangzho u/13 5 6 5/2018(H6 N2)毒株各基因片段最大相似度毒株均为国内H6N2 禽流感病毒,核苷酸最大相似性在96.85%~98.22%之间,氨基酸最大相似性在96.30%~99.30%之间.各基因片段均属于欧亚谱系,HA、PB2、PB1、PA、M、NS基因归属于ST33 9-like分支,NP基因归属于HN573-like分支,发生多分支进化来源的重组.NA基因在HxN2 亚型基因中归属于H6N2 分支.该病毒为禽源低致病性病毒,但在PB2-89 位、PB1-473 位、PB1-F2 蛋白、PA-409位、M1-30/215位、NS1-42/205位均发生对哺乳动物致病性增强的氨基酸变异.结论 广州地区禽类市场监测发现的1 株重组H6N2禽流感病毒,属于禽源低致病性病毒,但存在发生跨宿主传播的潜在风险,需加强监测.
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