北京市市售花蛤诺如病毒和轮状病毒检出情况及基因特征分析

目的 了解北京市市售花蛤诺如病毒和轮状病毒检出情况,分析其基因特征.方法 2014年11月-2015年10月,采集北京市三个水产品销售市场新鲜花蛤各24件.用两种方法对花蛤鳃和肠内容物进行病毒浓缩,提取核酸后用实时荧光RT-PCR法检测诺如病毒GⅠ/GⅡ组和A组轮状病毒核酸.用半巢式RT-PCR方法,扩增诺如病毒阳性样本衣壳蛋白VP1区基因,对PCR阳性产物进行测序,用诺如病毒分型工具进行基因亚型鉴定,用MEGA软件最大似然法构建进化树.结果 72件花蛤中未检出A组轮状病毒,诺如病毒检出率为34.7％(25/72),GⅡ组、GⅠ组和GⅠ/GⅡ组混合检出率分别为27.8％ (20/72)、4.2％(3/72)和2.8％(2/72).11月诺如病毒检出率最高,为100.0 ％(6/6);三个水产销售市场诺如病毒检出率分别为25.0％(6/24)、50.0％(12/24)和29.2％ (7/24).10件测序成功,其中6株为GⅡ.17,GⅡ.6、GⅡ.2、GⅠ.3a和GⅠ.4各1株.这些毒株与腹泻患者和外环境参考毒株相似性为97.9％ ～ 100.0％.结论 北京市市售花蛤存在诺如病毒污染,而且与腹泻患者和外环境参考毒株高度同源,应加强花蛤及销售人群和环境的诺如病毒监测.