SARS-CoV-2 S蛋白结构与功能的生物信息学分析

在以往的研究中发现,冠状病毒的S蛋白对其入侵宿主细胞起着决定性的作用.本研究从美国国立生物技术信息中心(national center for biotechnology information,NCBI)获取SARS-CoV-2 S蛋白基因的核苷酸序列及其编码蛋白的氨基酸序列,利用DNAMAN、DNAstar、Mega 7.0及一些在线分析预测网站对S蛋白进行生物信息学分析.结果 表明,SARS-CoV-2与SARS-CoV的S蛋白同源性较高,推测两种毒株的S蛋白结构与功能具有相似性.S蛋白含有信号肽序列;潜在磷酸化氨基酸数目共有136个,且其余氨基酸均有较高的磷酸化倾向;N-糖基化位点有17个;S蛋白是一种膜上蛋白,含有S1和S2两个结构域;二级结构预测结果中α螺旋占28.59％,β转角占3.38％,延伸链占23.25％,无规则卷曲占44.78％.四级结构显示完整的S蛋白是由3个单体结合而成.本研究可为SARS-CoV-2感染宿主细胞的机理研究及特异性的治疗提供一定的理论基础.