玉米重要农艺性状的基因组预测分析

以玉米白交系郑683-1为轮回亲本,ZPH1388、ZPH5和东237为供体亲本构建BC3F5群体,对穗部和株型性状进行基因组预测分析,研究2种交叉验证方式、6种GS方法和显著数量性状位点(QTL)作为固定效应对预测准确性的影响.结果 表明,相比5折交叉验证,10折交叉验证可以提高穗粒数、行粒数、株高和穗位高的预测准确性,降低穗行数和叶夹角的预测能力.相比随机效应模型,穗粒数、穗行数、行粒数和叶夹角将1～2个QTL作为固定效应可以提高基因组估计育种值的准确性,将1～5个QTL作为固定效应会降低穗位高的预测能力.对于株高,贝叶斯A和再生核希尔伯特空间将1～5个QTL作为固定效应可以提高预测的准确性,其他4种方法多数情况固定效应的加入会降低株高的预测能力.在穗粒数和株高中,基因组最佳线性无偏预测的准确性最高,略高于4种贝叶斯方法,再生核希尔伯特空间的准确性最低.对于其他4个性状,最优预测方法受不同交叉验证方式和固定效应模型的影响表现不一.