基于GEO数据挖掘与网络药理学探讨活血化瘀方治疗口腔扁平苔藓的机制研究
Journal of Oral Science Research（2022）
摘要
基于GEO数据库挖掘OLP的潜在治疗靶点,基于网络药理学分析活血化瘀方治疗OLP的主要化学成分、潜在作用靶点与治疗机制.采用R语言爬取GEO数据库中GSE52130数据集,通过差异分析得出OLP的异常表达基因;基于TCMSP数据库获取活血化瘀方中相关化学成分与靶点,利用Perl、Cytoscape软件和String绘制该药方成分-靶点网络与蛋白-蛋白互作网络;通过R语言完成关键靶基因的基因本体论(GO)分析与基因组百科全书(KEGG)分析.结果表明:活血化瘀方治疗OLP的关键化学成分共28个,包括槲皮素、山奈酚、豆甾醇等;核心作用靶点共13个,包括IL-1β、PTGS2(COX-2)、MAO等.KEGG分析发现活血化瘀方可影响神经递质代谢、巨细胞病毒感染、AGE-RAGE等通路,为后续中医药治疗口腔扁平苔藓的深入研究提供理论参考.
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