类风湿关节炎和原发性干燥综合征患者肠道菌群的比较分析

目的:探讨类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)患者与原发性干燥综合征(primary Sj?gren's syndrome,pSS)患者肠道菌群的组成结构及评估肠道微生物群组成的差异性.方法:采集2019年1月至2020年3月我院收治的14例RA患者和14例pSS患者的晨起粪便.收集每份粪便样品的细菌总DNA,PCR扩增,应用Illumina hiSeq 2500高通量测序技术对16S rDNA基因的V3～V4区进行测序,得出2组样本的菌群生物信息数据,然后结合文献智库信息对得出的数据进行组间OTU分析、菌群结构多样性分析以及差异分析.结果:利用Shannon指数等绘制稀释曲线,并进行数据复杂度分析,结果显示所测数据量完整,可以反映研究对象中所有微生物的多样性信息.菌群多样性比较:2组α多样性指数分析中ACE指数、Chao1指数、Shannon指数、Simpson指数比较差异无统计学意义(P>0.05);菌群结构比较:序列分析结果显示2组在门水平和属水平上的主要菌门和主要菌属上差异无统计学意义(P>0.05);菌群结构的差异性分析:高维生物标识和基因组特征分析显示2组菌群差异有统计学意义(P<0.05).根据LDA SCORE(effect size)大小,RA组核心菌群是Proteobacteria门、Bifidobacterium-adolescontis种,pSS组核心菌群是Bacteroidetes门、Bacteroidia纲、Bacteroidales目.结论:2种疾病肠道菌群具体种类上存在差异性.