高通量测序技术在探索芽菜微生物群落结构中的应用

China Condiment(2022)

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摘要
文章主要通过高通量测序技术探索市场上不同品牌宜宾芽菜之间细菌菌群结构的差异性.采用Alpha多样性分析和Beta分析,从门水平上对细菌菌群结构分析,发现优势菌门是厚壁菌门(Firmicutes),在3个样本中占比分别为43.77%、50.73%、45.59%;在种的水平上进行分析发现,优势菌种是鼠乳杆菌(Lactobacillus murinus),在3个样本中占比分别为10.51%、9.87%、11.92%.此外,还在芽菜中检测出脑膜炎嗜冷杆菌(Psychrobacter meningitidis)和荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)等腐败致病菌.结果表明,3种品牌宜宾芽菜之间细菌菌群结构有一定差异,并且市场上流通芽菜的微生物安全需要改善.
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