基于RNA-Seq的子宫内膜癌灶与癌旁组织差异表达基因分析

目的 利用转录组测序(RNA sequencing,RNA-Seq)技术分析肥胖相关子宫内膜癌(Endometrial Cancer,EC)癌灶及癌旁组织中的差异表达基因,寻找肥胖相关EC发生、发展的相关危险因素.方法 对4例超重/肥胖伴EC患者的癌灶和癌旁组织进行转录组测序,筛选差异表达基因,并运用生物信息学技术对差异基因进行功能和通路富集分析.结果 在EC癌灶及癌旁组织中共筛选出2451个差异表达基因,包含1697个上调基因,754个下调基因.GO功能富集分析表明:肥胖相关EC的发生发展与细胞间粘附调节、有丝分裂进程和错误蛋白折叠结合等一系列生物学进程密切相关.KEGG功能富集分析表明:肥胖相关EC的发生发展与病毒致癌、细胞周期、Hippo信号通路、细胞凋亡和p53信号通路等密切相关.结论 Hippo信号通路、p53信号通路和NETs信号通路可能在肥胖相关EC发生发展过程中发挥重要作用.