细粒棘球绦虫3-羟基酰基-CoA脱氢酶基因的克隆及在其不同阶段的差异表达和生物信息学分析

目的 研究细粒棘球绦虫3-羟基酰基-CoA脱氢酶分子特性及其在细粒棘球绦虫不同发育阶段的表达差异.方法 通过分析细粒棘球绦虫原头蚴高通量转录组测序文库对Unigene进行KEGG通路分析,筛选出一个脂肪酸代谢酶通路及该通路的一个主要调控基因3-羟基酰基-CoA脱氢酶基因.PCR扩增3-羟基酰基-CoA脱氢酶基因,分析其核苷酸序列及其编码蛋白的结构和功能;通过实时荧光定量PCR分析虫体的原头蚴、成虫发育阶段的mRNA的转录情况.结果 细粒棘球绦虫3-羟基酰基-CoA脱氢酶基因具有完整的开放阅读框,cDNA全长为822 bp,编码274个氨基酸.生物信息学预测3-羟基酰基-CoA脱氢酶蛋白质的相对分子质量及等电点分别为32.98× 105和8.87.该蛋白无跨膜螺旋区,具有亲水性,且具有多个潜在的优势抗原表位.氨基酸序列多重比对分析显示其与多房棘球绦虫亲缘关系较近.实时荧光定量PCR检测对该基因在原头蚴和成虫期均有表达,以成虫阶段表达量更高.结论 细粒棘球绦虫3-羟基酰基-CoA脱氢酶基因在原头蚴和成虫期高表达,其编码蛋白具有潜在的优势抗原表位该基因可作为细粒棘球绦虫终末宿主抗原候选基因.