水稻抗白叶枯病基因Xa23启动子变异及功能标记
Rice Genomics and Genetics（2020）
摘要
Xa23是广谱强效的水稻抗白叶枯病显性基因,其与等位感病基因xa23功能差异在于启动子上的被水稻白叶枯病菌无毒效应因子avrXa23能识别激活28 bp核心序列(EBEavrXa23),开发其功能标记能够加快水稻育种进程.本研究检测43份国外野生稻、7份代表性常规稻的Xa23启动子,利用生物信息软件Vector NTI对启动子上游200 bp序列进行分析.结果 表明,只有9份普通野生稻,2份常规稻能扩增出启动子上游约200 bp序列,检出率只有22.0％,说明Xa23不广泛存在于水稻中;进一步的序列分析显示,EBEavrXa23序列存在丰富的变异,其等位序列至少存在7种单倍型,但EBEavrXa23只存在水稻CBB23中.最后,依据EBEavrXa23序列开发了Xa23显性功能标记,经验证该标记能明确区分水稻是否携Xa23基因.本研究将有助于进一步研究Xa23进化机制及分子标记辅助选择育种.
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