老年2型糖尿病病人心血管病死亡相关外周血全基因组DNA甲基化的研究

Practical Geriatrics(2022)

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摘要
目的 利用全基因组DNA甲基化芯片技术,分析老年T2DM心血管病死亡病人和非死亡病人外周血全基因组DNA甲基化基因的差异,寻找与老年T2DM病人心血管病死亡相关的异常甲基化位点.方法 选取南京医科大学附属老年医院糖尿病分阶段达标管理(China Staged Diabetes Targeting Management,SDTM)项目截至2017年12月底结局事件为心血管病死亡的12例T2DM病人为病例组,采用倾向性评分法进行对照的匹配,卡钳值设置为0.02选取同期仍存活的12例T2DM病人作为对照组.使用Illumina Methylation BeadChip芯片技术检测外周血全基因组DNA甲基化水平.采用DAVID数据库对差异具有统计学意义的甲基化位点基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析.结果 共发现差异甲基化位点303个.GO功能分析显示,差异甲基化位点基因参与的生物学过程主要有:(1)神经系统发育、细胞黏附分子、血糖稳态和树突发育正调控等生物过程;(2)质膜的组成成分、树突和细胞质核周区细胞成分;(3)钙离子结合和序列特异性DNA结合分子功能.KEGG信号通路分析结果显示,差异甲基化基因主要参与细胞内环磷酸腺苷(cAMP)信号通路和炎症介质对瞬时受体电位离子(TRP)通道的调节通路.结论 DNA甲基化修饰可能与T2DM病人的心血管病死亡结局相关.
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