16S rRNA在常见致病分枝杆菌菌种鉴定中的应用

目的 通过分析16 S rRNA在不同分枝杆菌中的异同,探讨测序技术有关的实验和数据处理问题.方法 采用Mega6.0软件对34株非结核分枝杆菌分离株及美国国家生物技术信息中心(NCBI)现有的55株常见致病分枝杆菌和1株诺卡菌的16S rRNA序列进行比对分析,并用Maximum Likelihood法构建进化树,最后用DNASTAR/MegAlign程序计算种间及种内相似性.结果 PCR扩增后获得长度约为1500 bp的目的片段,与下载获得的16S rRNA序列进行比对分析并剪齐后保留1248 bp,16S rRNA可以将常见致病性分枝杆菌分为18群,种间相似性为91.5％～100.0％,种内相似性为99.0％～100.0％.结论 16S rRNA种内保守性高且具有较好的种特异性,除了龟分枝杆菌和脓肿分枝杆菌、鸟分枝杆菌和胞内分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌和胃分枝杆菌、溃疡分枝杆菌和海鱼分枝杆菌、人型分枝杆菌和牛型分枝杆菌不能分开外,16 S rRNA可将常见致病性分枝杆菌各种分开,可作为一种较好的鉴定分枝杆菌的方法.