广东HCV进化与注射吸毒者HCVNS5B区正向选择位点的分析研究

目的 了解广东HCV进化与注射吸毒者(IDUs)HCVNS5B区正向位点的选择压力情况.方法 随机收集广东141(人)份HCV RNA阳性献血者和58(人)份HCV患者标本做HCV NS5B序列扩增,结合前期测序得到的2009年～2011年的献血者和IDUsHCVNS5B序列,用分子进化遗传学分析(MEGA)软件做同源性分析,贝叶斯进化分析抽样树(BEAST)软件包做进化分析,用Datamonkey在线软件包进化的混合效应模型(MEME)方法对IDUs分离的序列做选择压力分析,用进化分析软件Arlequin的Tajima和Fu中性检验分析种群扩张情况.结果 本组IDUs不同亚型内部同源性比较结果为:HCV-3b同源性最高(97％),其次为HCV-3a(96％),HCV-6a(95％)和HCV-1b(94％);HCV进化速率分析显示:HCV-1b的进化速率最快[2.17E-03替换数/位点/年(y/y/y)],其次为HCV-3b(2.12E-03 y/y/y),HCV-3a(1.58E-03 y/y/y)和 HCV-6a(1.28E-03 y/y/y);HCV 理论感染人数分析:1980 年～1990 年是 HCV-6a快速增长期,1990年～1995年是HCV-1b快速增长期,2000年～2007年是HCV-3a快速增长期;HCV群体遗传特征:HCV-1b、3a、3b和6a均经历了种群扩张,其中3a和3b最明显.HCV选择压力分析:IDUs NS5B序列中339个核苷酸有2个正向选择位点(第235和243位点),但此段基因的5个直接抗病毒药物(DAA)位点仅在第316位点发生了突变[突变率1.24％(14/1 130)].结论 广东地区HCV3b进化呈明显的种群扩张趋势,尤其在当地IDUs中的比例、同源性较高,应作为本地区HCV防治的重点.鉴于广东IDUsHCVNS5B基因片段的正向选择位点均非DAA结合位点,因此设想DAA对这些患者有较好的疗效.