dndC基因在脉冲场凝胶电泳基因组降解中的作用及降解处理方法

目的 了解大肠埃希菌和弗格森埃希菌dndC基因的携带情况,以及该基因与脉冲场凝胶电泳(PFGE)基因组降解表型之间的关系,探讨PFGE中菌株基因组降解的原因及处理方法.方法 使用PFGE对450株大肠埃希菌和弗格森埃希菌进行分析,设计引物检测dndC基因的携带情况并进行序列测定.通过dndC基因序列比对和进化树的构建,获得dndC基因型别以及其在不同型别大肠埃希菌中的分布.通过添加硫脲和消毒电泳仪研究基因组降解的处理方法.结果 450株大肠埃希菌和弗格森埃希菌中,降解的菌株为40株(8.89％).dndC基因阳性菌株33株(7.33％),均出现了降解.大肠埃希菌携带的dndC基因可分为8个群.不同型别大肠埃希菌中均存在dndC基因阳性菌株,且阳性率存在差异.添加硫脲可以有效缓解PFGE分析中 dndC基因导致的降解,电泳仪消毒可以缓解全胶降解的情况.结论 dndC基因会导致大肠埃希菌和弗格森埃希菌PFGE分析中基因组降解,添加硫脲可以缓解此降解.