肺腺癌干性相关分子预后预测模型的构建及验证

目的 构建肺腺癌干性相关分子预后预测LASSO模型并验证其有效性.方法 应用R语言包"DESeq2"筛选TCGA肺腺癌-癌旁间差异表达基因,R语言包"WGCNA"分析差异表达基因和干性指数mRNAsi相关性以筛选中枢干性相关差异表达基因,R语言包"glmnet"构建肺腺癌干性相关分子预后预测LASSO模型,R语言包"rms"构建基于该LASSO风险模型和各临床病理特征的列线图.结果 共筛选得8 010个差异表达基因和1 437个中枢干性相关差异表达基因.当λ=0.038 79,获得20个带有非零风险系数的基因组成最优干性LASSO风险模型.Kaplan-Meier曲线和ROC曲线结果表明该模型在试验组、内部验证组和外部验证组(GSE72094)中均能有效预测肺腺癌预后.相比单纯临床病理指标列线图(C指数=0.668,95％CI:0.608～0.727),基于该风险模型的列线图(C指数=0.803,95％CI:0.765～0.841)预测效率显著提高(P＜0.001).临床决策曲线进一步表明基于该风险模型的列线图可能给肺腺癌患者带来更高的临床获益度.结论 本研究成功构建的肺腺癌干性相关分子预后预测LASSO模型,可能是对目前肺腺癌TNM临床分期的有效补充.