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核仁蛋白16在肺腺癌中的表达及其临床意义

Chinese Journal of Diagnostics (Electronic Edition)(2022)

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摘要
目的:探讨核仁蛋白16(NOP16)在肺腺癌(LUAD)中的表达及其临床意义。方法:收集并比较癌症基因组图谱数据库(TCGA)中445例LUAD和54例正常肺组织样本NOP16 mRNA表达水平的差异,收集、验证并比较基因表达综合数据库(GEO)中226例LUAD和20例正常肺组织样本NOP16 mRNA表达水平的差异;采用Wilcoxon秩和检验和Kruskal-Wallis H检验比较不同临床病理特征的LUAD患者NOP16 mRNA表达水平的差异;通过Kaplan-Meier法评估NOP16在LUAD中的预后价值;采用基因集富集分析(GSEA)探讨NOP16在LUAD中可能参与的生物学通路;通过肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库评估NOP16 mRNA表达水平与肿瘤浸润性免疫细胞(TIICs)的关系。结果:在LUAD中NOP16 mRNA表达水平明显高于正常肺组织(P<0.01),且不同临床分期、T分期、N分期的LUAD患者NOP16 mRNA表达水平均差异有统计学意义(均P<0.05)。Kaplan-Meier生存分析表明NOP16 mRNA的高表达与LUAD患者的不良预后相关(P<0.05)。GSEA显示在NOP16高表达组,核糖体、DNA复制、错配修复、p53信号通路被显著富集(P<0.05,FDR<0.25)。在LUAD中,NOP16 mRNA表达水平与B细胞(r=-0.22)、CD4+ T细胞(r=-0.25)、CD8+ T细胞(r=-0.12)、中性粒细胞(r=-0.18)、巨噬细胞(r=-0.27)和树突状细胞(r=-0.25)的浸润丰度均呈负相关(均P<0.01)。结论:NOP16有望成为LUAD诊断和预后评估的生物标志物以及免疫治疗的新靶点。
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