转录组分析揭示溶藻弧菌感染早期大黄鱼的免疫应答特征

为探究大黄鱼(Larimichthys crocea)抗溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)感染的免疫应答机制,研究通过转录组测序及生物信息学分析的手段,在转录组水平分析了溶藻弧菌感染24h后大黄鱼头肾中基因表达水平的变化,共获得1903个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),其中641个上调表达基因,1262个下调表达基因.通过Gene Ontology(GO)和Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)富集分析发现,一些先天性免疫相关基因,包括补体(C1qbp、C1QL2和C7)、热休克蛋白(hspd1、hspa4、hspa5和hspa9)、抗菌肽(Hepcidin-1)、C型凝集素受体(Clec4e和MR1)、己糖激酶(hex1)、精氨酸酶(Arg-II)和线粒体翻译延伸因子(TUFM)等基因表达水平均显著上调;而许多与获得性免疫相关基因,包括T、B淋巴细胞增殖分化(FcR5和CCL17)、T细胞调控(TCRα、TCRβ、CD3ε、CD3γδ、CD3ζ、ZAP-70和ITK)及免疫球蛋白参与抗原识别(Ighv 5A、Ighv 914和Ighv XIG14)等基因表达水平均显著下调.结果表明,在感染早期,大黄鱼先天性免疫在抵御溶藻弧菌感染中发挥重要作用,而此时获得性免疫受到了抑制.