长链非编码RNA LINC00342在头颈鳞癌中的生物学功能及临床意义

目的:明确长链非编码RNA LINC00342表达水平与头颈鳞状细胞癌（简称鳞癌）患者临床病理参数的关系，研究 LINC00342在头颈鳞癌细胞中的生物学功能。 方法:分析癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas，TCGA）数据库头颈鳞癌转录组中 LINC00342的表达，利用转录组测序技术检测山西医科大学第一医院27例喉鳞癌组织中该基因的表达；利用实时荧光定量聚合酶链反应（real-time quantitative polymerase chain reaction，qPCR）检测人胚肺二倍体细胞2BS和头颈鳞癌细胞系FD-LSC-1、CAL-27、Detroit562中 LINC00342的表达水平；使用RNA干扰（RNA interference，RNAi）技术敲降头颈鳞癌细胞中该基因的表达，利用细胞增殖检测试剂盒（cell counting kit-8，CCK-8）、克隆形成、流式细胞术、Transwell迁移和侵袭等实验检测肿瘤细胞恶性表型的变化；生物信息学方法构建以 LINC00342为核心的竞争性内源RNA（competing endogenous RNA，ceRNA）调控网络，并进行基因本体论（gene ontology，GO）富集分析。使用SPSS 25.0软件和GraphPad Prism 6软件进行统计学分析及作图。 结果:TCGA数据库收录的头颈鳞癌组织与数据库对应的正常组织相比， LINC00342的相对表达量差异无统计学意义（ P=0.522）；但其表达水平与患者颈淋巴结转移、病理学分级呈正相关，男性患者的表达水平高于女性患者（ P值均<0.05）。通过转录组测序发现， LINC00342在我院27例喉鳞癌中的相对表达量高于癌旁正常黏膜组织（ t=1.56， P=0.036）。 LINC00342在头颈鳞癌细胞系FD-LSC-1、CAL-27和Detroit562中表达均显著上调（ t值分别为-12.17、-23.26和-388.57， P值均<0.001）。分别转染si-LINC00342-1和si-LINC00342-2敲降 LINC00342，可抑制头颈鳞癌细胞FD-LSC-1、CAL-27和Detroit562增殖（ t值分别为8.95和4.84，2.70和5.55，2.02和3.70）、克隆形成（ t值分别为6.66和6.17，7.38和11.65，4.90和5.79）、迁移（ t值分别为8.21和7.19，5.76和6.46，6.28和9.92）和侵袭能力（ t值分别为9.29和10.25，11.30和11.36，8.02和8.66），同时促进FD-LSC-1及CAL-27细胞凋亡（ t值分别为-2.21和-5.83，-3.05和-5.25），差异有统计学意义（ P值均<0.05）。以 LINC00342为中心的ceRNA调控网络包括10个下调的微核糖核酸（microRNA）节点和647个上调的mRNA节点，GO分析表明这些mRNA主要聚类在22个生物过程、32个分子功能以及12个细胞组分方面。 结论:LINC00342高表达与头颈鳞癌恶性进展相关，具有促进头颈鳞癌细胞增殖、迁移、侵袭以及拮抗凋亡的重要生物学功能，是头颈鳞癌潜在的重要分子标志物。