广东省柯萨奇病毒A8型流行及其VP1基因特征分析

wf(2023)

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摘要
目的 了解广东省柯萨奇病毒A8型(CVA8)的流行特点及其基因特征.方法 收集2010-2020年广东省手足口病非EV71/CVA16/CVA6其他肠道病毒(其他EV)阳性样本,分型鉴定,选取CVA8阳性样本进行病毒分离,对获得的CVA8毒株进行VP1全长序列扩增与测序,运用生物信息学软件进行遗传进化分析.结果 2010-2020年手足口病2 650份其他EV样本中,CVA8占2.6%(69/2 650),每年的构成比在0.5%~12.0%,其中2020年最高;广东省共有13个地市检出CVA8,其中2020年7-11月汕头市检出最多(28例);对CVA8阳性样本进行病毒分离,阳性分离率为73.9%(51/69);遗传进化分析显示,CVA8可分为A、B、C、D和E等5个基因型,本研究44株CVA8毒株VP1核苷酸同源性为77.8%~100.0%,氨基酸序列同源性为92.9%~100.0%,包括D基因型(5株)和E基因型(39株);2020年7-11月汕头市28株CVA8流行株的核苷酸同源性为99.3%~100.0%,高度同源.结论 CVA8在广东省以散发流行为主,2020年7-11月在汕头市引起了手足口病的局部持续循环流行;广东省存在CVA8病毒D和E基因型的流行,其中E基因型是目前的流行株.
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