秋茄低温胁迫转录组分析及脱落酸信号途径基因挖掘

[目的]深入了解秋茄响应低温胁迫的分子机制以及培育秋茄的抗寒新品种.[方法]以耐寒红树植物'龙港'秋茄1年生容器苗为实验材料,15℃处理12h为对照组(CK),-5℃处理12h为低温组(LT),采用Illumina HiSeq测序平台进行转录组测序,挖掘脱落酸信号途径相关基因.[结果]转录组测序共鉴定到148个转录因子,分属于 25个转录因子家族,其中,ERF、NAC、WRKY、bHLH、MYB、bZIP、HB-oth-er和MYB-related等家族所包含的基因数量较多,分别为17、14、12、12、10、9、6和6;差异组共筛选到1330个差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs),其中,698(52.48％)个上调表达,632(47.52％)个下调表达;KEGG通路富集分析发现,DEGs显著富集在植物激素信号转导、苯丙素生物合成、半乳糖代谢、光合作用-天线蛋白和 α-亚麻酸代谢等通路中;脱落酸信号途径相关基因 KoPYL1、KoABF1和KoABF2上调表达,KoPP2C1和KoABF3下调表达,且这些基因表达情况与qRT-PCR验证结果一致.[结论]ERF、NAC、WRKY、bHLH、MYB、bZIP、HB-other和MYB-related等家族转录因子对秋茄响应低温胁迫起重要调控作用.植物激素信号转导、苯丙素生物合成、半乳糖代谢、光合作用-天线蛋白和α-亚麻酸代谢等是秋茄响应低温胁迫的重要 KEGG通路.脱落酸信号途径中的 KoPYL1、KoPP2C1、KoABF1、KoABF2和KoABF3基因可作为后期研究秋茄响应低温胁迫的重要候选基因.