膝关节OA关键基因及软骨组织免疫细胞浸润的生物信息学分析
Medical Science Journal of Central South China（2023）
摘要
目的 基于生物信息学筛选膝关节骨关节炎(OA)的关键基因、信号通路,并分析软骨组织免疫细胞浸润情况.方法 从GEO数据库中下载来自正常人和OA患者的基因数据集,进行差异表达基因筛选,基因本体论、京都基因和基因组百科全书分析,构建蛋白互作网络,并对软骨相关数据集进行免疫细胞浸润分析.结果 筛选出与OA相关的12 个关键基因及86 条关键信号通路.免疫浸润结果显示,OA软骨组织与正常软骨比较,其活化CD8T记忆细胞、CD56+NK细胞、髓系来源抑制性细胞、1 型辅助型T细胞4 种免疫细胞含量差异有统计学意义(P<0.05).结论 筛选出12 个关键基因和4 种免疫细胞,其可能参与了OA的进展.
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