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基于免疫基因的直肠癌预后模型的建立及验证研究

Chinese Journal of Practical Internal Medicine(2023)

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摘要
目的 构建基于免疫基因的直肠癌预后模型,并探索直肠癌免疫治疗靶点.方法 从UCSCXena下载直肠癌数据集(TCGA-READ),从GEO网站获取直肠癌数据集(GSE87211),将TCGA-READ和GSE87211分别作为训练组和验证组,基于免疫基因应用非负矩阵分解算法划分亚型并筛选差异基因.通过Cox回归分析构建风险评分模型,并使用Kaplan-Meier生存分析和受试者工作特征(ROC)曲线评价模型的有效性.分析评分与免疫的相关性,并对样本行基因集富集分析.构建列线图并绘制校准曲线评估其可信度.结果 基于27个差异基因构建了一个3基因的预后模型,低风险组总生存期长于高风险组(P<0.05).风险评分与多种免疫细胞和免疫检查点有关,样本富集在与癌症恶性进展有关的通路.列线图校准曲线拟合良好,有较强的应用价值.结论 预后模型有良好的预测效能,并发现潜在的直肠癌免疫治疗靶点.
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