RNA甲基化修饰检测研究进展

Pu Qinli,Chen Weixian

Journal of Chongqing Medical University(2023)

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摘要
RNA修饰是转录后调控基因表达的重要因素,在表观遗传学领域具有重要的研究意义.目前,许多已知的RNA修饰检测方法依赖抗体的特异性.最常用的是基于RNA甲基化免疫沉淀结合测序法(methylated RNA immunoprecipitation sequencing,MeRIP-seq),但这种方法也容易产生假阳性和假阴性结果.因此,近年来出现了一系列免抗体的测序方法,以及探索成本低廉、简单易操作的免抗体RNA修饰生物传感检测新方法.此外,特定位点的RNA修饰检测是探明甲基化对疾病具体调控机制的关键,单碱基分辨检测方法构建是必要的前提.本综述总结近年来RNA甲基化修饰特异性检测以及特定位点RNA修饰定量检测的新方法.主要从基于免疫途径、甲基化特异性酶途径、杂交方法、化学处理、标记技术以及RNA修饰原位检测技术进行总结归纳,分析不同检测方法的优点和不足.同时讨论了通用性检测方法及第三代测序用于直接检测RNA甲基化修饰的研究前景.
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