云南不同稻区稻瘟病菌群体遗传结构的SSR分析

为了解稻瘟病菌的群体遗传结构,选用13对SSR标记对2007-2013年分离自云南省陆稻区、籼稻区和粳稻区(共计13个州)的125个稻瘟病菌单孢菌株的全基因组DNA进行PCR扩增及分析,结果13对引物共检测出128个等位基因;聚类分析表明,在相似系数为0.57时,125个供试菌株可划分为29个遗传宗谱,优势宗谱YN02包含了 39个菌株,占总菌株数的31.20％,次优势宗谱YN08包含了 15个菌株,占总菌株数的12.00％,其余71个菌株分属27个宗谱;表明云南省既有优势宗谱,又有较多遗传多样性的小宗谱,菌株群体遗传多样性丰富;比较不同稻区菌株群体的宗谱频率发现,陆稻区菌株的宗谱频率为65.52％,粳稻区和籼稻区菌株的宗谱频率分别为27.59％和13.79％,表明陆稻区菌株群体的遗传结构比粳稻区、籼稻区菌株复杂.因此,针对菌株群体宗谱较少,且优势宗谱突出的地方,应加强品种多样化种植,有利于稻瘟病菌群体的稳定化选择,降低病害流行风险.