基于TCGA数据库的食管鳞癌代谢相关基因预后风险模型的建立

目的:探索影响食管鳞状细胞癌(ESCC)患者预后的代谢相关基因,构建ESCC患者的预后风险模型.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载食管癌的转录组数据和临床病例资料.从转录组数据中提取出代谢相关基因的数据,筛选ESCC组织和正常组织中差异表达的代谢基因.运用单因素COX分析、Lasso回归分析、多因素COX分析构建预后风险模型,并用受试者工作特征(ROC)曲线评估代谢相关基因预后模型的预测能力,并对高低风险组进行GSEA分析.结果:肿瘤组和对照组共存在280个差异表达的代谢相关基因,其中乙醛脱氢酶1A1(ALDH1A1)、黑酸1,2-二加氧酶(HGD)以及DNA引物酶多肽1(PRIM1)与ESCC的预后相关.Kaplan-Meier分析显示,相较于低风险组,高风险组的总体生存期降低(P＜0.01).ROC曲线分析及多因素COX回归分析表明,该预后模型具有良好的预测效能[曲线下面积(AUC)=0.741],可以作为一个独立的预后因素(HR=11.66,P＜0.001).结论:基于代谢相关基因构建的预后风险模型可以作为ESCC患者的预后因素,为寻找新的食管癌治疗靶点提供了方向.