感染"褐色沉积症"虾夷扇贝的外套膜转录组测序及差异表达基因分析

为分析"褐色沉积症"形成分子机制,探究筏式养殖虾夷扇贝(Mizahopecten yessoensis)贝壳内侧褐色沉积症状形成原因,采用Illumina高通量测序平台对感染"褐色沉积症"虾夷扇贝和健康虾夷扇贝外套膜组织进行转录组测序分析.结果显示,患病和健康扇贝外套膜分别获得43862251和41806737条clean reads.经参考基因组比对分析,患病和健康扇贝外套膜表达基因数量分别为17835个和16816个,差异表达基因208个,其中上调基因170个,下调基因38个.选取6个差异表达基因进行荧光定量PCR(qRT-PCR)验证,结果证明转录组测序分析可靠.GO功能富集发现差异基因主要富集在几丁质代谢、含氨基葡萄糖化合物代谢、几丁质结合和氨基糖代谢等与几丁质合成代谢相关的通路;KEGG通路富集分析发现差异基因主要参与内质网蛋白质合成、内吞作用、剪接体和谷胱甘肽代谢等途径;对差异表达倍数显著的前40个基因分析发现,编码类咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶(caffeoyl-CoA O-methyltransferase-like,CCOAOMT-L)、类 1-氨基环丙烷-1 羧酸合酶(1-aminocyclopropane-l-carboxylate synthase-like protein,ACCS-L)、黄蛋白(protein yellow-like)、热休克蛋白 70(HSP70)、过氧化物酶成熟因子(DUOXA1)、多烯脂肪酸异构酶(poly enoic fatty acid isomerase,PFI)、Na+/Cl+依赖的甘氨酸转运蛋白(sodium-and chloride-dependent glycine transporter,GlyT1)、类酪氨酸酶(putative tyrosinase-like protein,Putative Tyr-3)、Toll 样受体(protein toll)等与蛋白质醌鞣化、免疫、氧化、神经传递相关的基因与褐色沉积症形成密切相关,揭示了虾夷扇贝外套膜褐色沉积症形成的内在原因.