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云南省HIV-1 CRF01_AE毒株分子网络分析

Chinese Journal of Microbiology and Immunology(2023)

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摘要
目的:了解云南省HIV-1 CRF01_AE毒株的分子网络特征及相关影响因素。方法:收集2018—2021年云南省耐药监测数据库中HIV/AIDS患者的人口学资料,采集患者血浆,逆转录聚合酶链反应扩增HIV-1 pol基因蛋白酶和逆转录酶区并进行序列测定,选择最适基因距离,基于基因型为CRF01_AE的序列构建分子网络。 结果:通过序列测定共获得967余CRF01_AE亚型毒株序列,在1.75%最适基因距离阈值下,共有320条序列进入网络,入网率为33.1%,共鉴别出84个簇。在地区分布网络中形成1个多地区连接的簇,1个以昭通为主的簇,1个以红河为主的簇以及5个以文山为主的簇。网络中75.8%异性传播的男性与其他异性传播的男性连接,其次与异性传播的女性连接(54.1%)。66.7%的男男同性性行为人群(MSM)之间存在潜在传播关联。入网影响因素分析结果显示,与昆明市比较,楚雄州、大理州、德宏州、红河州、临沧市、普洱市、文山州、玉溪市以及昭通市的HIV/AIDS患者更容易进入网络。年龄≥50岁人群较<25岁人群更容易进入网络。未发现云南省基因型为CRF01_AE的HIV/AIDS患者成为高危传播者的影响因素,需进一步探索高危传播者相关影响因素。结论:云南省HIV-1 CRF01_AE毒株在不同地区活跃传播,传播关系复杂,应加强对CRF01_AE毒株的动态监测,针对高危传播者采取精准干预,从而减少新发感染。
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关键词
HIV-1,CRF01_AE,Molecular network
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