喜树转录因子CaERF1的克隆与生物信息学分析
Molecular Plant Breeding（2023）
摘要
AP2/ERF(APETALA2/ethylene response factor)家族转录因子在调控植物生长以及次生代谢积累等方面具有重要功能.本研究从喜树叶片中克隆AP2/ERF家族转录因子,并利用生物信息学分析该转录因子序列与结构.结果表明,从喜树叶片中成功克隆了 597bp大小的转录因子,并命名为CaERF1,成功构建重组质 粒pGMT-CaERF1;CaERF1蛋白由199个氨基酸组成,与拟南芥中ORA47具有较高同源性,且属于不稳定的亲水性蛋白质;二级结构以无规则卷曲占比最高,为68.84％,并在15～80氨基酸区域存在一个AP2结构功能域.该转录因子的克隆以及结构分析为进一步研究CaERF1的功能奠定基础,同时为研究AP2/ERF类转录因子调控喜树碱等次生代谢产物合成提供数据支持.
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