基因芯片分析Narasin对雌激素受体阳性乳腺癌细胞基因表达的影响

目的 通过基因芯片技术分析Narasin处理对雌激素受体阳性(ER+)乳腺癌细胞基因表达的影响.方法 选取ER+乳腺癌MCF-7细胞株,用0.05 mmol·L-1 Narasin进行处理,将处理后的细胞分为对照组C(未经Narasin处理的3个重复组C1、C2、C3)及实验组T(经0.05 mmol·L-1 Narasin处理的3个重复组T1、T2、T3),并进行RNA的提纯;将RNA通过Affymetrix Gene Chip Prime View人类基因表达阵列进行分析,利用R语言limma包筛选出未经Narasin处理和0.05 mmol·L-1 Narasin处理的MCF-7细胞中的差异表达基因(DEGs),进而通过KEGG通路和GO富集分析研究DEGs的功能分布.结果 根据基因芯片的数据进行分析,发现DEGs共111个,其中82个基因表达上调,29个基因表达下调(差异均在1.5倍以上),且细胞中过表达与乳腺癌预后不良相关基因CYP24A1、EYA2 等经Narasin处理后基因表达下调.GO富集分析结果显示,下调的DEGs主要富集在先天免疫系统、Ⅰ型干扰素信号通路、病毒基因组复制的负调控、免疫反应、伤口愈合、细胞迁移、基因表达调控、细胞黏附、膜的锚定组件、细胞因子活性、酶结合、DNA结合、双链RNA绑定等.KEGG通路分析结果显示,下调的DEGs主要富集于癌症中的小分子核糖核酸、单纯疱疹病毒感染、麻疹、黏着斑、ECM-受体相互作用、PI3K-Akt信号通路、甲型流感、Rap1信号通路及糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路等.结论 基因芯片技术快速有效地反映了Narasin处理后ER+乳腺癌细胞相关基因及信号通路的改变,这些关键基因和通路为探讨Narasin作用的分子机制及关键靶标提供了新方向.